Avouons-le, la Méditerranée, ces derniers temps, je ne la vois que par la fenêtre du labo (même mon bureau et ma chambrent donnent sur des cours). Peu importe. Je vais parler d’un projet (ambitieux) qui la concerne directement, et qui me plaît beaucoup: un projet de recherche, d’information, et de préservation de sa biodiversité.
Il m’a attiré le regard de manière plutôt brutale. Il faut dire, aussi, que je ne m’attendais pas à trouver un livre de parasito dans le rayon “Sciences” de la librairie à côté de chez moi. Enfin peu importe, passons aux choses sérieuses.
Ecologie et évolution des systèmes parasités
est le titre d’un livre de 427 pages, paru le 8 mai chez DeBoeck, dont les auteurs principaux sont Frédéric Thomas, Jean-François Guégan, et François Renaud (dont j’avais lu des papiers pour mon stage). La liste des auteurs ayant contribué à ce livre est, avouons-le, assez impressionnante.
Le livre est d’un niveau vraiment soutenu (cycle M - doctorat, d’après les recommandations de l’éditeur), manière polie de dire que j’ai trébuché sur certains passages. Le livre a le mérite de multiplier les points de vue sur le sujet, ce qui rend sa lecture très riche. Notamment, les relations entre les parasites, la biodiversité, la biologie de la conservation, sont largement traités.
Il présente des hypothèses vraiment intéressantes, que j’avais déja recontré au fil de mes lectures. Et possède une annexe de méthodologie qui m’a bluffée (description et schémas des techniques les plus courantes, quasiment un “guide de survie à l’usage du jeune étudiant laché dans un labo”).
Autre caractéristique, et pas des moindres: une liste des principales équipes travaillant sur le sujet de ce livre, avec les contacts et une description des axes de recherche occupe une des annexes. Quand on cherche un stage, par exemple, ça peut servir…
Ce livre est tout en haut de ma wishlist du moment, vous l’auriez compris.
Nota : Je vais essayer de faire des “fiches de lecture” pour certains bouquins que j’apprécie assez, dans l’hypothèse ou ça pourrait aider certains.
Je suis en pleine séance de stats, et j’ai besoin de calculer l’index de diversité de Brillouin, qui me donne la diversité des parasites présents sur chaque individu. Excel ayant quelques difficultés, j’ai écrit une petite fonction en R qui me fait ça tout à fait bien.
Dans cet index, N représente le nombre total d’individus parasites sur chaque individu hôte, et ni est le nombre d’individus d’une espèce i. Je passe sur les raisons de son utilisation, pour donner la formule:
brillouin <- function(pop) {(log(factorial(sum(pop)))-sum(log(factorial(pop))))/sum(pop)}
ou pop est un array qui contient l’ensemble des valeurs ni. La fonction s’utilise en faisant brillouin(variable), ou directement brillouin(c(n1,n2,…nk)).
Je me permet de vous parler d’un article assez ancien, puisqu’il date de juillet 2006. Publié dans TREE, et sobrement intitulé Is a healthy ecosystem one that is rich in parasites?
, il fait un résumé du rôle des parasites dans l’écosystème en général, et se base sur un postulat qui semble aller à l’inverse de nos intuitions : la diversité des parasites dans un écosystème est révélatrice de sa santé globale (hypothèse que je soutiens furieusement, à mon niveau).
