<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><rss version="2.0"
	xmlns:content="http://purl.org/rss/1.0/modules/content/"
	xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"
	xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom"
	>
<channel>
	<title>Comments on: Science : peut-on tout dire sur le net?</title>
	<atom:link href="http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net/feed" rel="self" type="application/rss+xml" />
	<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net</link>
	<description>Avec des vrais morceaux de plathelminthes dedans!</description>
	<pubDate>Fri, 04 Jul 2008 06:04:31 +0000</pubDate>
	<generator>http://wordpress.org/?v=2.5.1</generator>
		<item>
		<title>By: On peut tout dire sur le net (mais des fois, rien dire, c&#8217;est bien) &#124; Le blog du Doc&#8217;</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-4430</link>
		<dc:creator>On peut tout dire sur le net (mais des fois, rien dire, c&#8217;est bien) &#124; Le blog du Doc&#8217;</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 20 Nov 2007 22:25:31 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-4430</guid>
		<description>[...] commentaires peut-on tout dire sur le Net? &#171; Coffee and Sci(ence) on Science : peut-on tout dire sur le net?Benjamin on Un mot latin qui veut dire oui…Timothée on Un mot latin qui veut dire oui…Benjamin [...]</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>[...] commentaires peut-on tout dire sur le Net? &laquo; Coffee and Sci(ence) on Science : peut-on tout dire sur le net?Benjamin on Un mot latin qui veut dire oui…Timothée on Un mot latin qui veut dire oui…Benjamin [...]</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: peut-on tout dire sur le Net? &#171; Coffee and Sci(ence)</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-4426</link>
		<dc:creator>peut-on tout dire sur le Net? &#171; Coffee and Sci(ence)</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 20 Nov 2007 20:40:07 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-4426</guid>
		<description>[...] A nouveau pos&#233;e r&#233;cemment dans un billet &#224; deux auteurs, Thimoth&#233;e et Tom Roud et un referee, Enro, mais cette fois dans le contexte de la communication scientifique: Science, peut-on tout dire sur le net? [...]</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>[...] A nouveau pos&eacute;e r&eacute;cemment dans un billet &agrave; deux auteurs, Thimoth&eacute;e et Tom Roud et un referee, Enro, mais cette fois dans le contexte de la communication scientifique: Science, peut-on tout dire sur le net? [...]</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: vincent fleury</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3977</link>
		<dc:creator>vincent fleury</dc:creator>
		<pubDate>Wed, 07 Nov 2007 10:00:28 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3977</guid>
		<description>Tout ceci est incompréhensible. La seule explication que je vois, c'est la toxicité de l'internet, le phénomène de la rumeur et l'incompétence de personnes qui prennent la parole pour critiquer avant d'avoir compris.

j'ai publié dans 

Vincent Fleury, An elasto-plastic model of avian gastrulation, Organogenesis, 2, 1, 6-16, 2005.

 un modèle de mouvements de blastula parfaitement cohérent, qu'on a parfaitement le droit de critiquer (même des personnes comme M. Vekris capables de se tromper et de positionner les forces de traction cellulaires à l'envers...)

j'ai publié dans :

Thi-Hanh Nguyen, Anne Eichmann, Ferdinand Lenoble, and Vincent Fleury, Dynamics of vascular branching morphogenesis: The effect of blood and tissue flow, Phys. Rev. E 73, 061907 (2006) 

un modèle parfaitement cohérent de déformation de tissus embryonnaires, avec des évidences expérimentales


j'ai publié dans

Vincent Fleury, Alia Al-Kilani, Mathieu Unbekandt and Thi-Hanh Nguyen, The textural aspects of vessel formation during embryo development, and their relation to gastrulation motions, Organogenesis, 3,1, 49-56, (2007).

des observations expérimentales et un modèle montrant comment s'organisent les parties des embryons sous l'effet des écoulements tissulaires

J'ai déduit de ces travaux un modèle global de formation d'embryons, avec les conséquences pour l'évolution, que j'ai présenté devant environ 300 personnes à l'université de Louvain, (facultés de Namur) et dont le texte est longuement repris dans Revue des Questions scientifiques tome 177, 2006 N°3-4 Vincent Fleury, La mathématisation complète d'un vertébré s'avère possible pp235-278

texte, donc, d'une conférence, publié sous l'autorité d'un comité de lecture ouvert. 

Les évolutions successives de ces idées ont été présentées dans de très nombreux endroits (Nantes, Rennes, Paris, Meudon, Los Angeles...) devant de larges publics.

Compte tenu de la nouveauté et de la difficulté de tout ça, j'ai commis un livre de environ 200 pages sorti en novembre 2006 (donc après ou juste en même temps que les publications en question) expliquant tout en détail avec de nombreuses figures de calculs et non de "dessins" comme écrit dans la presse.

Ce système de blogs est à sens unique: on peut dire n'importe quelle connerie, gravée pour l'éternité en un clic. Effacer ces conneries est impossible.

Quand on sait ça, on surveille ce qu'on écrit avant d'écire des choses comme 

il lui serait très facile de publier ses données, ou cette formule mathématique. Qu’il ne l’ait pas fait, c’est cela que je trouve hautement suspect. 

Ben non, je ne suis suspect de rien du tout.

Tout rapprochement de mon activité avec du créationnisme est diffamatoire.

Merci à ceux qui gardent les yeux ouverts et font des remarques normales, voire positives. 

VF</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>Tout ceci est incompréhensible. La seule explication que je vois, c&#8217;est la toxicité de l&#8217;internet, le phénomène de la rumeur et l&#8217;incompétence de personnes qui prennent la parole pour critiquer avant d&#8217;avoir compris.</p>
<p>j&#8217;ai publié dans </p>
<p>Vincent Fleury, An elasto-plastic model of avian gastrulation, Organogenesis, 2, 1, 6-16, 2005.</p>
<p> un modèle de mouvements de blastula parfaitement cohérent, qu&#8217;on a parfaitement le droit de critiquer (même des personnes comme M. Vekris capables de se tromper et de positionner les forces de traction cellulaires à l&#8217;envers&#8230;)</p>
<p>j&#8217;ai publié dans :</p>
<p>Thi-Hanh Nguyen, Anne Eichmann, Ferdinand Lenoble, and Vincent Fleury, Dynamics of vascular branching morphogenesis: The effect of blood and tissue flow, Phys. Rev. E 73, 061907 (2006) </p>
<p>un modèle parfaitement cohérent de déformation de tissus embryonnaires, avec des évidences expérimentales</p>
<p>j&#8217;ai publié dans</p>
<p>Vincent Fleury, Alia Al-Kilani, Mathieu Unbekandt and Thi-Hanh Nguyen, The textural aspects of vessel formation during embryo development, and their relation to gastrulation motions, Organogenesis, 3,1, 49-56, (2007).</p>
<p>des observations expérimentales et un modèle montrant comment s&#8217;organisent les parties des embryons sous l&#8217;effet des écoulements tissulaires</p>
<p>J&#8217;ai déduit de ces travaux un modèle global de formation d&#8217;embryons, avec les conséquences pour l&#8217;évolution, que j&#8217;ai présenté devant environ 300 personnes à l&#8217;université de Louvain, (facultés de Namur) et dont le texte est longuement repris dans Revue des Questions scientifiques tome 177, 2006 N°3-4 Vincent Fleury, La mathématisation complète d&#8217;un vertébré s&#8217;avère possible pp235-278</p>
<p>texte, donc, d&#8217;une conférence, publié sous l&#8217;autorité d&#8217;un comité de lecture ouvert. </p>
<p>Les évolutions successives de ces idées ont été présentées dans de très nombreux endroits (Nantes, Rennes, Paris, Meudon, Los Angeles&#8230;) devant de larges publics.</p>
<p>Compte tenu de la nouveauté et de la difficulté de tout ça, j&#8217;ai commis un livre de environ 200 pages sorti en novembre 2006 (donc après ou juste en même temps que les publications en question) expliquant tout en détail avec de nombreuses figures de calculs et non de &#8220;dessins&#8221; comme écrit dans la presse.</p>
<p>Ce système de blogs est à sens unique: on peut dire n&#8217;importe quelle connerie, gravée pour l&#8217;éternité en un clic. Effacer ces conneries est impossible.</p>
<p>Quand on sait ça, on surveille ce qu&#8217;on écrit avant d&#8217;écire des choses comme </p>
<p>il lui serait très facile de publier ses données, ou cette formule mathématique. Qu’il ne l’ait pas fait, c’est cela que je trouve hautement suspect. </p>
<p>Ben non, je ne suis suspect de rien du tout.</p>
<p>Tout rapprochement de mon activité avec du créationnisme est diffamatoire.</p>
<p>Merci à ceux qui gardent les yeux ouverts et font des remarques normales, voire positives. </p>
<p>VF</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: Timothée</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3923</link>
		<dc:creator>Timothée</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 05 Nov 2007 16:41:49 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3923</guid>
		<description>J'abonde dans le sens de Tom Roud. Le même genre de difficultés existe à l'intérieur d'une discipline (par exemple la biologie : ne faites rien de trop pluridisciplinaire si vous voulez que vos correcteurs comprennent… — on m'a déjà demandé si ce que je faisais "existait vraiment", et "si il y avait la moindre chance que ce soit publié", pour info), je n'ose même pas imaginer ce qui existe à la frontière entre deux disciplines.

Je crois la même chose: cette théorie finira par être publiée, malgré l'opposition. On a toujours un peu de mal à voir les théories audacieuses passer la revue (cf Van Valen, mais pas que…), mais elles finissent pas passer. Espérons que ce soit le cas une fois encore.</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>J&#8217;abonde dans le sens de Tom Roud. Le même genre de difficultés existe à l&#8217;intérieur d&#8217;une discipline (par exemple la biologie : ne faites rien de trop pluridisciplinaire si vous voulez que vos correcteurs comprennent… — on m&#8217;a déjà demandé si ce que je faisais &#8220;existait vraiment&#8221;, et &#8220;si il y avait la moindre chance que ce soit publié&#8221;, pour info), je n&#8217;ose même pas imaginer ce qui existe à la frontière entre deux disciplines.</p>
<p>Je crois la même chose: cette théorie finira par être publiée, malgré l&#8217;opposition. On a toujours un peu de mal à voir les théories audacieuses passer la revue (cf Van Valen, mais pas que…), mais elles finissent pas passer. Espérons que ce soit le cas une fois encore.</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: Tom Roud</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3921</link>
		<dc:creator>Tom Roud</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 05 Nov 2007 16:32:21 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3921</guid>
		<description>J'ajoute sur le peer-review : typiquement, dans ce cas-là, on a un reviewer physicien, un reviewer biologiste. Je suis sûr que c'est côté biologie que cela bloque; c'est classique. D'ailleurs, VF en parle dans son livre : un reviewer lui a sorti par exemple que le concept de "body plan" n'existait pas en biologie (ou un truc dans le genre), ce qui a de quoi énerver.</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>J&#8217;ajoute sur le peer-review : typiquement, dans ce cas-là, on a un reviewer physicien, un reviewer biologiste. Je suis sûr que c&#8217;est côté biologie que cela bloque; c&#8217;est classique. D&#8217;ailleurs, VF en parle dans son livre : un reviewer lui a sorti par exemple que le concept de &#8220;body plan&#8221; n&#8217;existait pas en biologie (ou un truc dans le genre), ce qui a de quoi énerver.</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: Tom Roud</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3920</link>
		<dc:creator>Tom Roud</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 05 Nov 2007 16:29:06 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3920</guid>
		<description>@ Pascal : l'interface physique biologie, c'est effectivement très vaste. Cela va des purs physiciens qui tirent sur l'ADN à des théoriciens plus ou moins fous qui travaillent sur les réseaux invariants d'échelles. Pourtant, dans son domaine, je pense que VF est relativement seul. Rares sont les gens qui ont à la fois son expertise dans la physique non-linéaire et connaissent la biologie de la gastrulation. Je vous assure que trouver des reviewers compétents, cela n'est pas toujours de la tarte. 

Et la différence de culture scientifique est difficile à surmonter. 

Maintenant, ce que je pense en tant que "pair" de VF :
- qu'il sait de quoi il parle au niveau physique
- qu'il n'en est pas à son coup d'essai en matière d'étude de l'embryon et de morphogenèse
- que ce que j'ai lu de sa théorie n'est certainement pas plus mauvais que la plupart des papiers théoriques publiés à l'interface physique biologie. Par contre, c'est certainement beaucoup plus créatif et plus ambitieux.

Je ne comprends donc pas très bien cet acharnement à essayer de le faire passer pour un crackpot incompétent. Personnellement, même si c'est long et douloureux, je crois qu'au final sa théorie finira par être publiée quelque part et que des gens la citeront (même si elle s'avère au final complètement fausse).</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>@ Pascal : l&#8217;interface physique biologie, c&#8217;est effectivement très vaste. Cela va des purs physiciens qui tirent sur l&#8217;ADN à des théoriciens plus ou moins fous qui travaillent sur les réseaux invariants d&#8217;échelles. Pourtant, dans son domaine, je pense que VF est relativement seul. Rares sont les gens qui ont à la fois son expertise dans la physique non-linéaire et connaissent la biologie de la gastrulation. Je vous assure que trouver des reviewers compétents, cela n&#8217;est pas toujours de la tarte. </p>
<p>Et la différence de culture scientifique est difficile à surmonter. </p>
<p>Maintenant, ce que je pense en tant que &#8220;pair&#8221; de VF :<br />
- qu&#8217;il sait de quoi il parle au niveau physique<br />
- qu&#8217;il n&#8217;en est pas à son coup d&#8217;essai en matière d&#8217;étude de l&#8217;embryon et de morphogenèse<br />
- que ce que j&#8217;ai lu de sa théorie n&#8217;est certainement pas plus mauvais que la plupart des papiers théoriques publiés à l&#8217;interface physique biologie. Par contre, c&#8217;est certainement beaucoup plus créatif et plus ambitieux.</p>
<p>Je ne comprends donc pas très bien cet acharnement à essayer de le faire passer pour un crackpot incompétent. Personnellement, même si c&#8217;est long et douloureux, je crois qu&#8217;au final sa théorie finira par être publiée quelque part et que des gens la citeront (même si elle s&#8217;avère au final complètement fausse).</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: vincent fleury</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3919</link>
		<dc:creator>vincent fleury</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 05 Nov 2007 16:25:12 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3919</guid>
		<description>mais c'est quoi ces conneries
merde, mes formules sont parfaitement publiées
arrêtez tout ça.

je passe ma vie à aller raconter ce que je fais dans des labos, où je suis très bien accueilli. 
Y'a que sur internet où on asiste à ce n'importe quoi.</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>mais c&#8217;est quoi ces conneries<br />
merde, mes formules sont parfaitement publiées<br />
arrêtez tout ça.</p>
<p>je passe ma vie à aller raconter ce que je fais dans des labos, où je suis très bien accueilli.<br />
Y&#8217;a que sur internet où on asiste à ce n&#8217;importe quoi.</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: pascal Lapointe</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3916</link>
		<dc:creator>pascal Lapointe</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 05 Nov 2007 14:55:14 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3916</guid>
		<description>Tom: Je ne suis pas sûr que le problème d'évaluation par les pairs soit vraiment un obstacle; il me semble que si on veut trouver des évaluateurs compétents (je n'ai pas dit "objectifs", c'est un tout autre problème, que Vincent Fleury pourrait évidemment exploiter à son avantage), on peut toujours en trouver; la discipline appelée biophysique me semble, a priori, à l'interface de la biologie et de la physique. Par ailleurs, je suis sûr que Vincent Fleury n'est pas le seul scientifique à jongler avec des notions de biologie et de physique, pas à notre époque où l'origine de la vie est un domaine de recherche aussi foisonnant.

Mais même si on admettait que c'est là le seul obstacle. Il existe des milliers de revues scientifiques sans comité de révision. Il existe ArXiv. Il existe Internet. Si Vincent Fleury voulait vraiment être évalué par d'autres scientifiques, il lui serait très facile de publier ses données, ou cette formule mathématique, et que sais-je encore. Bref, d'en faire une théorie cohérente, complète, capable d'être évaluée, critiquée, débattue en connaissance de cause. Qu'il ne l'ait pas fait, c'est cela que je trouve hautement suspect. 

Peut-être sa "théorie", si théorie il y a, est-elle fondée. Mais ni vous ni moi ni personne n'est en mesure de le dire, sur la seule base de ce qu'il a publié. Et en se concentrant trop sur le fait que son université a fermé son site web, on court le risque de passer complètement à côté de ce problème, pourtant fondamental pour comprendre la justesse de sa théorie. N'est-ce pas comme si on ne se concentrait que sur "l'ostracisme" dont est soi-disant victime un créationniste de la part de la communauté scientifique?</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>Tom: Je ne suis pas sûr que le problème d&#8217;évaluation par les pairs soit vraiment un obstacle; il me semble que si on veut trouver des évaluateurs compétents (je n&#8217;ai pas dit &#8220;objectifs&#8221;, c&#8217;est un tout autre problème, que Vincent Fleury pourrait évidemment exploiter à son avantage), on peut toujours en trouver; la discipline appelée biophysique me semble, a priori, à l&#8217;interface de la biologie et de la physique. Par ailleurs, je suis sûr que Vincent Fleury n&#8217;est pas le seul scientifique à jongler avec des notions de biologie et de physique, pas à notre époque où l&#8217;origine de la vie est un domaine de recherche aussi foisonnant.</p>
<p>Mais même si on admettait que c&#8217;est là le seul obstacle. Il existe des milliers de revues scientifiques sans comité de révision. Il existe ArXiv. Il existe Internet. Si Vincent Fleury voulait vraiment être évalué par d&#8217;autres scientifiques, il lui serait très facile de publier ses données, ou cette formule mathématique, et que sais-je encore. Bref, d&#8217;en faire une théorie cohérente, complète, capable d&#8217;être évaluée, critiquée, débattue en connaissance de cause. Qu&#8217;il ne l&#8217;ait pas fait, c&#8217;est cela que je trouve hautement suspect. </p>
<p>Peut-être sa &#8220;théorie&#8221;, si théorie il y a, est-elle fondée. Mais ni vous ni moi ni personne n&#8217;est en mesure de le dire, sur la seule base de ce qu&#8217;il a publié. Et en se concentrant trop sur le fait que son université a fermé son site web, on court le risque de passer complètement à côté de ce problème, pourtant fondamental pour comprendre la justesse de sa théorie. N&#8217;est-ce pas comme si on ne se concentrait que sur &#8220;l&#8217;ostracisme&#8221; dont est soi-disant victime un créationniste de la part de la communauté scientifique?</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: Tom Roud</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3913</link>
		<dc:creator>Tom Roud</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 05 Nov 2007 13:14:34 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3913</guid>
		<description>@ Oldcola : On dérive, on dérive ... VF a publié de nombreux papiers dans le domaine de la croissance des tissus, papiers pas moins intéressants ou utiles que CompuCell3D. Donc il s'agit clairement d'une difficulté de publication ponctuelle.</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>@ Oldcola : On dérive, on dérive &#8230; VF a publié de nombreux papiers dans le domaine de la croissance des tissus, papiers pas moins intéressants ou utiles que CompuCell3D. Donc il s&#8217;agit clairement d&#8217;une difficulté de publication ponctuelle.</p>
]]></content:encoded>
	</item>
	<item>
		<title>By: oldcola</title>
		<link>http://www.le-doc.info/2007/10/26/239-science-peut-on-tout-dire-sur-le-net#comment-3905</link>
		<dc:creator>oldcola</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 05 Nov 2007 08:13:31 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://www.le-doc.info/?p=239#comment-3905</guid>
		<description>@ Pascal, Tom :
Je ne pense pas que dans l'un ou l'autre de mes posts j'ai nié les mouvements cellulaires! Ce qui me différencie largement de VF est que j'entends prendre en compte les gradients morphogènes connus, les différences de comportement (adhésion, chimiotactisme, etc.) des cellules suivant l'expression différentielle du génome.
En cela je ne me sens pas dissocié des efforts de plusieurs physiciens qui travaillent dans le domaine, dont Newman SA, Forgacs G, Glazier JA, qui eux ne semblent pas avoir des problèmes pour publier et qui savent très bien se faire comprendre par les biologistes, moi y compris. Et qui produisent des outils fort élégants et utiles, e.g. CompuCell3D.</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>@ Pascal, Tom :<br />
Je ne pense pas que dans l&#8217;un ou l&#8217;autre de mes posts j&#8217;ai nié les mouvements cellulaires! Ce qui me différencie largement de VF est que j&#8217;entends prendre en compte les gradients morphogènes connus, les différences de comportement (adhésion, chimiotactisme, etc.) des cellules suivant l&#8217;expression différentielle du génome.<br />
En cela je ne me sens pas dissocié des efforts de plusieurs physiciens qui travaillent dans le domaine, dont Newman SA, Forgacs G, Glazier JA, qui eux ne semblent pas avoir des problèmes pour publier et qui savent très bien se faire comprendre par les biologistes, moi y compris. Et qui produisent des outils fort élégants et utiles, e.g. CompuCell3D.</p>
]]></content:encoded>
	</item>
</channel>
</rss>
