Questions de recherche

Le spectre d’hôte des pathogènes est-il une information utile en santé publique?

Parmi les informations sur un pathogène qui sont utiles pour déterminer s’il faut s’y intéresser d’un point de vue de santé publique, le spectre d’hôte figure en bonne position. Ce billet tente d’expliquer pourquoi, en présentant aussi les raisons pour lesquelles les pathogènes à large spectre d’hôte peuvent provoquer des émergences.

Virus et bactéries : qui sont les plus émergents?

Comment deux études successives sur l’émergence de pathogènes chez l’homme peuvent elle faire varier la proportion de virus émergents du simple au double? Une légère modification de la méthode de comptage suffit…

Sciences et société

Le débat sur les OGM ne doit pas être uniquement technique

Le débat sur les OGM doit-il être confisqué à la société civile, pour le placer aux mains des experts,”protégé” des querelles idéologiques? Cette “spécialisation” du débat n’est-elle pas un risque à la fois de dérive scientiste et d’amplification des craintes de la société vis-à-vis d’une technologie nouvelle? Marcel Kuntz et Jean-Paul Oury ne semblent pas le croire… Moi si.

Débat en cours : Marie-Monique Robin, les blogueurs, et les autres

Quelles sont les méthodes de Marie-Monique Robin dans sa réponse à l’AFIS et aux blogueurs? Peut-on encore espérer quelque chose du débat entre elle (l’obscurantisme) et l’AFIS (le scientisme)?

Revue de presse

L’intégration de gènes par transfert horizontal prend des millions d’années

Dans leur papier paru très récemment dans Mol Biol Evol, Lercher & Pal [1] se posent une question toute simple. Si, comme on le pense, les transferts horizontaux (échanges de gènes entre des bactéries) ont une valeur adaptative, et sont utiles dans un nouvel environnement, ces gènes transférés devraient être intégrés aux réseaux existants de […]

D’où nous viennent nos gènes de vertébrés?

D’où nous viennent nos gènes de vertébrés? Où plutôt, de qui ? C’est la question à laquelle Anuphap Prachumwat et Wen-Hsiung Li, de l’université de Chicago, apportent des éléments de réponse, dans une lettre adressée aujourd’hui au journal Genome research.
On imagine bien sûr que nos lointains ancêtres invertébrés, rampants et se tortillant, nous ont légué […]

Opinions (et réflexions)

Trouvez l’auteur : innovation scientifique et exposition au blâme

Trouvé par hasard alors que je traversai la moitié de la côté méditerranéenne pour aller rejoindre ma petite famille non loin de Marseille (on notera au passage l’usage quasi monomaniaque de la virgule)…
La science, qui ne fait que commencer, et qui n’a donc encore poussé les choses ni jusqu’à l’exhaustivité du détail ni jusqu’à la […]

Blogs et information scientifique : les lendemains ne chantent plus…

Quand, alors qu’il publie un billet sur le reportage Le monde selon Monsanto, un blogueur se voit menacé d’une accusation pour diffamation, on est en droit de se demander si la liberté d’information scientifique des blogs face à certaines dérives des médias traditionnels n’est pas clairement menacée.

Ma vie au labo

La construction du nid de Symphodus melops

La construction du nid du poisson Symphodus melops est une des choses que je voulais observer depuis un certain temps. Aujourd’hui c’est fait, même si j’ai mis quelques instants à comprendre ce que je voyais. Et comme j’avais mon appareil photo sous la main, vous avez des photos d’un mâle très bright dans ses œuvres!

La lumière (UV) au bout du tunnel

Des semaines.
Des semaines que je l’attend, que je la traque. Que j’arrive le matin au labo plein d’espoir. Que je repars le soir tout dépité, en me demandant si c’est moi qui ne suis plus bon à rien, si le destin est contre moi, si je dois me reconvertir.
Elle?
Oui, elle, une petite bande sur un […]

Outils (et geekeries)

Test T de Student par permutations pour R

Mes tribulations mathématiques m’ont récemment poussé dans le monde assez fabuleux des tests par permutation, et je viens de consacrer une grosse demi heure à écrire pour R le test T de Student par permutations, pour m’affranchir de l’homogénéité des variances et de la normalité des données.
Vu que c’est du code qui peut servir, je […]

Tour d’horizon des logiciels de bibliographie

En cette période de projet biblio qui démarrent, il est temps de faire un rapide tour d’horizon des logiciels de gestion de la bibliographie, qui vont aider nos chers étudiants (c’est nous) à ne pas perdre de temps dans leur travail. La question numéro 1 a se poser quand on veut choisir son logiciel, c’est […]